罗伯特将杰克逊他们带到泛大陆的神经中枢峰峦一号，那里是牧羊人科学家们的实验室，杰克逊在那里见到了尼尔森博士，才知道罗伯特假死的两年内一直待在那里，而与诺亚计划搅和在一起，也是实验室的安排。米奇和杰米打算去抢纯净DNA，却发现有人先他们一步，用迷药迷晕了戴维斯的人，而他们进去后才发现，想夺DNA的人竟然是洛根。米奇一见到洛根，便想给洛根打麻醉针，可没想到洛根穿上了防弹衣，而此时戴维斯已经发现有人闯入，让米奇他们不得不跟洛根合作。米奇将DNA装车之后离开，却被戴维斯围在了门口，他只能假装在车上装了装置，想要拖延戴维斯的时间，给杰米他们逃跑。戴维斯识穿了米奇的阴谋，洛根只能拿出自己身上的手榴弹，真的在车上装上引爆装置，等他和杰米下车后就马上引爆，炸毁了车上的DNA。尼尔森给杰克逊解释了他们的工作任务，并说明他们已经养了很多鸟，准备在研制出解药之后，通过鸟来将解药以禽流感的方式传出去，拯救所有动物。因为研制解药还差一只剑齿猫，而剑齿猫又非常会隐藏自己，所以达瑞拉决定用她来把剑齿猫引出来。亚伯拉罕阻止不了达瑞拉，只能保护达瑞拉，跟里斯一起去找剑齿猫。因为DNA被毁，戴维斯只能下令停止诺亚计划，他的副将门萨劝说不了戴维斯只能杀了戴维斯，然后通知继续执行诺亚计划。随后门萨杀死了其他人，将米奇他们放走，让他们前往事先安排的地方，准备去见杰克逊他们。因为达瑞拉的出现，剑齿猫被引出来了，亚伯拉罕为了保护达瑞拉，被剑齿猫咬着不放，里斯于是趁此机会将针打入剑齿猫体内，可没想到却被剑齿猫拉着到处跑，里斯不幸牺牲了。达瑞拉和亚伯拉罕拿到了剑齿猫的DNA，米奇也回来了，而杰克逊的情况则越来越严重，可米奇却不愿意让杰克逊再用罗伯特的药来减缓变异，因为这段时间动物变异很快，他不知道他们的解药是否来得及阻止动物变异。杰克逊感觉到自己的情况快要控制不住了，他私下要求亚伯拉罕，在他控制不住自己之时，让亚伯拉罕亲手杀了他，以免他伤害到别人。米奇在实验室里，看到了治他女儿的药，他才明白过来，他女儿的病情也是因为罗伯特他们的实验而产生的病。米奇因为罗伯特也注射过鬼影基因，而想到了办法研制解药，他将罗伯特的血输送到杰克逊体内，增加杰克逊体内的浓度，然后再给杰克逊注射血清，排出解药化合物。虽然找到了解药，可杰克逊体内的解药化合物的量根本不够，杰克逊因此宁愿放干自己的血也要救所有动，罗伯特不能让杰克逊如此牺牲，所以他也让米奇为他注射，将他的血继续输送给杰克逊，以排出更多的解药化合物。罗伯特死了，米奇的解药也研制出来了，正等着释放那些鸟传播解药，这也完成了克洛伊的所愿。一切大功告成，米奇便想带着杰米回去见克莱曼婷，让杰米通知飞行员起飞，这时她才知道门萨将诺亚计划继续实行，毒气已经被释放了。
