1531年,与教皇抗争失败后,亨利要求议会宣布他为英格兰教堂之首,以获得废除和凯瑟琳婚姻的权力,遭到了以莫尔为首的忠于罗马教廷者,极力抗击这一超前的异端之举。凯瑟琳因为亨利提出的教堂之首的议案,特意把托马斯叫来责备,指责他怂恿亨利做出如此危险之举。经过投票,亨利的决议得到了多数票数,让他成功通过了议案成为英格兰教堂之首。托马斯为了救被抓的律师朋友詹姆士,以及为自己谋一个官职,特意去求安妮,想让安妮跟亨利求个情,安妮很轻易就答应了托马斯,让詹姆士公开认错就能获得自由。安妮在谈完了公事之后,看到了托马斯手上的礼物,便好奇的追问了一下。托马斯说明,那是他准备送给安妮仆人简的礼物,安妮听了之后忍不住笑了起来,然后把简的父亲约翰与儿媳通奸被抓的事情说出来,说明现在托马斯送礼物有些不合时宜。哈利向教堂提出申请婚姻无效,因为他与安妮有婚约在身,安妮为此非常烦恼,把托马斯找来想办法,想要证明她与哈利之间没有肌肤之亲。托马斯抓住了安妮想要登上后座的心理,借这个机会让安妮除掉亨利,以达到为沃尔西复仇的目的,所以他建议安妮是时候该摆脱亨利了。托马斯去找躲起来的哈利,替安妮警告了哈利,说明亨利再敢说安妮爱他的话语,诺福克一定会将他剥皮剔骨,让他最好识相地收起他的那套言论。解决了哈利的事情,莫尔也被踢出局,安妮与亨利之间再无阻碍,而大法官变成了托马斯的朋友克兰默,托马斯的政坛之路看起来一片光明。亨利领着安妮进入坎伯雷特大教堂之时,伊丽莎白以圣女的身份跑来,直指安妮是异教徒,如果亨利不除掉安妮坚持跟安妮大婚,那么他的统治期将只剩下七个月。诺福克他们不允许伊丽莎白散播谣言,直指伊丽莎白的所为将被送去妓院,然后将他们全部赶走。事后,托马斯去了加莱教堂,跟伊丽莎白要求,想听一下旧主沃尔西是否有什么遗言,而伊丽莎白则带着托马斯去见博金神父,想要遵从神父的意见。与别国使臣外交的时候,安妮一直在角落里与外国国王亲密,亨利心里很是不高兴,托马斯看到了觉得那是个很愚蠢的举动,所以马上去提醒诺福克。诺福克看到安妮的举止,马上把她叫回了舞池,令安妮特别的不愉快。一切大功告成之际,玛丽想要私会托马斯,跟他好好消遣一番,没想到威廉会突然出现,托马斯差点将威廉当成行刺者杀死,让他也再没有兴致与玛丽消遣。1533年,亨利和安妮正式在教堂举行婚礼,成为合法夫妻,随后安妮进行受洗戴上王冠仪式,真正成为王后。随后,安妮顺利怀孕了,而她在挺着大肚子之时,还不忘与凯瑟琳一伙争权夺势,担心自己的儿子即将出世,会惹来凯瑟琳他们的谋害。托马斯四处奔走,想要救出好友詹姆士,最终都没能成功,詹姆士还是被执行了火刑,让托马斯心里很郁闷。