神盾局有一套自己的情报安全管理机制，即情报等级权限访问制度。不同的数字等级对应不同级别的访问许可，该分级一共有十个等级，神盾局指挥官的等级一般为9级或10级。等级1~3（非保密信息访问权限）。该等级一般归类于非前线特工，或试用期间的前线特工以及待深入调查背景的雇佣特工。等级4（保密信息访问权限）。大多数新人、普通科研和医护人员、少数行政人员都归属于此特工级别，新入职人员将通过努力工作和获取必要培训来达到更高的等级。等级5（机密许可访问权限）。又称“附属秘密”或“普通机密”访问权限，申请这个级别需要国家机关、本地机关和相关担保单位进行为期数月到一年进行全面背景调查，可以了解到组织上大部分普通情报和部分上级允许的特殊机密。等级6~7（高级机密许可访问权限）。6~7级特工仅由顶级特工授予，他们获知的机密往往关系到国家安全，有些高级的科研开发人员和医护人员也分属于这个等级。等级8~9（绝密信息授权许可）。一般8级特工至少必须为组织效力十年以上（如科尔森、手特工等），除非是非常特殊的人才或正在从事极其敏感的项目可能会被授予一个临时8级（如美国队长）。等级10（绝密隔间眼睛只）。这个级别没有特殊说明，只有极少数的男性和女性特工拥有10级权限，例如尼克·弗瑞。
